醫院是江蘇省衛生健康委直屬的三級甲等綜合醫院，擔負著醫療、教學、科研、公益等重要任務。醫院有三個院區（姜家園院區、薩家灣院區和邁皋橋院區），占地面積共83畝，建筑面積16萬平方米，固定資產8.45億元，其中專業設備5.26億元；編制床位數1700張，實際開放床位數1697張，開放病區45個，職工2700余人。

醫院年門急診量約177萬人次，年出院病人數約7萬人次，手術量約2.6萬臺次。現有臨床科室37個，其中省級臨床重點專科15個（含建設單位），分別為消化內科、小兒內科、腎臟內科、婦產科、老年醫學科、內分泌科、腫瘤科、泌尿外科、眼科、耳鼻咽喉科、心血管內科、神經內科（建設單位）、普外科（建設單位）、醫學影像科（建設單位）、呼吸內科（建設單位）。消化醫學中心和腎臟病中心為江蘇省“十三五科教強衛工程”醫學重點學科，并且兩個科室都進入《2018年中國醫院科技值（STEM）排行榜》百強。醫院還是國家衛生計生委（原衛生部）全科醫師培訓基地、消化內鏡診療培訓基地、婦科四級腔鏡診療培訓基地、臨床藥師培訓基地、住院醫師規范化培訓基地（24個專業）。醫院現有醫技科室10個，能夠滿足全身各個器官的診斷，開展各種類型的化驗診斷。

醫院擁有一大批高層次人次，其中高級職稱481人，享受政府特殊津貼專家7人，省突出貢獻中青年專家2人，省雙創團隊1個，省雙創人才2人，省特聘教授、醫學專家6人，“333工程”第二層次培養對象5人、第三層次培養對象38人，省“六大人才高峰”培養對象46人，省衛計委“十三五科教強衛工程”醫學創新團隊4個、醫學重點人才5人、青年醫學人才19人。

醫院是國家藥監總局和國家衛生健康委批準的國家藥物臨床試驗機構（藥物臨床試驗專業12個）。醫院有南京醫科大學校級重點實驗室2個（慢性腎臟病研究實驗室、整合腸病研究實驗室）。近三年，醫院共獲得科研項目239項，其中省級以上課題57項，國家自然科學基金32項；發表SCI論文320篇；獲得中華醫學科技獎三等獎1項，江蘇省科學技術二等獎1項、三等獎1項，江蘇醫學科技獎1項，江蘇省婦幼健康引進新技術獎1項，江蘇省教育教學與研究成果獎一等獎1項，江蘇省醫學新技術引進獎9項，江蘇中醫藥科技獎1項，江蘇省腫瘤醫學科技獎一等獎1項，南京市政府科技進步二等獎1項。兒科學（16位）、腎臟病學（21位）、心血管病學（57位）、消化病學（61位）、呼吸病學（75位）、普通外科學（84位）、腫瘤學（89位）入圍2017年度《中國醫院科技影響力排行榜》專科全國百強。2018年度Nature Index發布的自然指數排行榜第45位。

作為南京醫科大學直屬的附屬醫院、南京醫科大學第二臨床醫學院，醫院有4個學系、11個教研室，擁有教授18位、副教授52位、博士生導師22位、碩士生導師95位。目前在院學習的本科生和研究生（含博士）600余人，年理論課時數4000余學時。

醫院始終秉承“敬佑生命、救死扶傷、甘于奉獻、大愛無疆”的醫院精神，踐行“至精至誠、至善至愛”的宗旨，堅持“以病人為中心”，深化醫改、內抓質量、外樹形象，不斷提升醫療服務、教育教學、科學研究、文化傳承與創新的能力，努力打造一所“國內知名、省內一流、百姓信賴”的大型綜合醫院，為“健康江蘇”“健康中國”貢獻力量。