醫(yī)院是全國(guó)肝膽病防治技術(shù)示范基地、全國(guó)妊娠乙肝防治示范基地，全國(guó)脂肪肝規(guī)范診療中心，難治性癌痛規(guī)范化診療示范基地、江蘇省博士后創(chuàng)新實(shí)踐基地。國(guó)家藥物臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)。醫(yī)院同時(shí)是江蘇省傳染科醫(yī)療質(zhì)量控制中心、省中西醫(yī)結(jié)合肝病研究中心、省病毒性肝炎診療中心、省重癥瘧疾診療中心、省重危孕產(chǎn)婦救治指導(dǎo)中心、南京市消化病臨床醫(yī)學(xué)中心、南京地區(qū)市級(jí)胸痛救治中心建設(shè)單位。

醫(yī)院有國(guó)家臨床重點(diǎn)專科1個(gè)，省重點(diǎn)學(xué)科、專科7個(gè)，市重點(diǎn)專科4個(gè)，國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室1個(gè)。其中感染性疾病科為國(guó)家級(jí)臨床重點(diǎn)專科，感染性疾病學(xué)為江蘇省醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科。傳染科、腫瘤科、婦產(chǎn)科、普通外科、肝病科、結(jié)核科為江蘇省省級(jí)臨床重點(diǎn)專科，中西醫(yī)結(jié)合科為江蘇省示范中醫(yī)科，腸道及其他傳染病科、檢驗(yàn)科、醫(yī)學(xué)影像科、重癥醫(yī)學(xué)科為南京市臨床重點(diǎn)專科，中心實(shí)驗(yàn)室為南京市醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。

多年來(lái)，醫(yī)院堅(jiān)持科技興院，重視科研發(fā)展。近五年獲科研成果37項(xiàng)，其中部級(jí)獎(jiǎng)2項(xiàng)，省科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)5項(xiàng)，省衛(wèi)計(jì)委醫(yī)學(xué)新技術(shù)引進(jìn)獎(jiǎng)17項(xiàng)，南京市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)5項(xiàng)。承擔(dān)國(guó)家自然科學(xué)基金13項(xiàng)，傳染病防治國(guó)家科技重大專項(xiàng)10項(xiàng)，省部級(jí)科研項(xiàng)目30項(xiàng)。編寫專著41部，獲專利證書(shū)34項(xiàng)。發(fā)表SCI論文176篇（最高影響因子59.558），中華系列期刊論文90余篇。

“精誠(chéng)奉獻(xiàn)，惠澤民生”。多年來(lái)，南京市第二醫(yī)院堅(jiān)持公益惠民的宗旨，積極推進(jìn)醫(yī)聯(lián)體建設(shè)，并通過(guò) “黨員示范崗”“黨員志愿者“工人先鋒號(hào)”“青年文明號(hào)”等創(chuàng)建工作，持續(xù)提升社會(huì)效益。醫(yī)院以擔(dān)當(dāng)社會(huì)責(zé)任為己任，積極參與非典、重癥甲型H1N1流感、H7N9禽流感、埃博拉等重大傳染病救治，奔赴四川雅安地震災(zāi)區(qū)指導(dǎo)衛(wèi)生防疫工作，圓滿完成青奧會(huì)醫(yī)療保障等各項(xiàng)應(yīng)急保障任務(wù)，積極開(kāi)展援藏、援疆、援非對(duì)口支援。醫(yī)院先后榮獲衛(wèi)生部“全國(guó)抗非先進(jìn)集體”、中組部“全國(guó)抗非先進(jìn)黨組織”、全國(guó)抗“非典”工作先進(jìn)基層黨組織、榮獲國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委“人感染H7N9禽流感疫情防治工作中表現(xiàn)突出單位”、國(guó)家埃博拉出血熱疫情防控先進(jìn)集體榮譽(yù)稱號(hào)。

風(fēng)勁帆揚(yáng)，砥礪前行，如今的南京市第二醫(yī)院，翻開(kāi)嶄新的一頁(yè)。醫(yī)院將通過(guò)建設(shè)江蘇肝健康聯(lián)盟，進(jìn)一步創(chuàng)新互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)院模式，建立分級(jí)診療和雙向轉(zhuǎn)診機(jī)制，不斷增強(qiáng)醫(yī)療服務(wù)核心競(jìng)爭(zhēng)力和綜合實(shí)力。通過(guò)南京中醫(yī)藥大學(xué)、徐州醫(yī)科大學(xué)、東南大學(xué)等平臺(tái)，力爭(zhēng)成為專科特色顯著、中西醫(yī)并重、綜合能力強(qiáng)的三級(jí)甲等醫(yī)院，并在爭(zhēng)創(chuàng)國(guó)家級(jí)區(qū)域醫(yī)療中心的道路上，拼搏奮進(jìn)、開(kāi)拓創(chuàng)新，不斷增進(jìn)人民群眾健康福祉，向著以人民為中心，以健康促小康的目標(biāo)，不斷邁進(jìn)。