北京大學第三醫院（簡稱“北醫三院”）建于1958年，國家衛生健康委委管醫院，集醫療、教學、科研、預防、康復與保健為一體的綜合性三甲醫院。2018年底，在崗職工5157人，開放床位1891張。醫院有36個臨床科室、10個醫技科室。有27個博士點、1個臨床博士后流動站。在崗博士生導師57人，中國科學院院士1人、中國工程院院士1人，國家千人計劃1人，國家自然科學基金杰出青年基金獲得者3人、科技部“973”首席科學家1人、教育部“長江學者特聘教授”2人，2人入選國家級“新世紀百千萬人才工程”，青年千人計劃1人，國家自然科學基金優秀青年科學基金獲得者4人，衛生部突出貢獻專家10人。

北醫三院脊柱外科是國內最強的學科，生殖醫學中心的治療方法最全面、規模是國際最大之一，中國大陸首例試管嬰兒在此誕生。運動醫學研究所是新中國最早成立、國內唯一的中國奧委會指定運動員傷病防治中心。眼科在眼外傷、角膜移植、白內障和青光眼等方面處于國內第一方陣；消化科在潰瘍病發病機制研究及治療、早期胃癌的診療等領域居國內前列；心血管內科在冠心病介入治療、心臟病人康復治療、心血管臨床與基礎協調發展等方面成績突出；成形科、職業病科是國內率先成立的臨床特色學科。

經過幾代人的共同努力，北醫三院進入國內高水平醫院行列，有20個國家臨床重點專科（骨科、藥劑科（臨床藥學）、病理科、專科護理、檢驗科、消化科、婦科、產科、職業病科、耳鼻喉科、心血管分子生物學與調節肽重點實驗室、呼吸內科、神經內科、普通外科、泌尿外科、眼科、麻醉科、康復醫學科、成形科（整形外科）、運動醫學科），婦產科為國家婦產疾病臨床醫學研究中心，產科、康復醫學科為國家產科專業、國家康復醫學醫療質量管理和控制中心。

十多年來，北醫三院門、急診量始終居于北京市前列。2018年，服務門診患者403萬余人次，急診患者近27萬人次，出院患者逾11萬人次，完成手術6.3萬例次。平均住院日為5.51天/人次。在北京市DRGs（疾病診斷相關組）綜合評價中，北醫三院各項主要管理指標達先進水平。在北醫三院出院患者中，有三分之一來自全國各地。

北醫三院有18個北京市住院醫師規范化培訓專業基地、2個國家衛生健康委員會專科醫師規范化培訓基地、2個北京市住院醫師規范化培訓技能考核中心。作為北京大學臨床醫學院，每年有近800名醫學生、350余名博士生、碩士生。同時，承擔著1500余名進修醫生和近400名北京市住院醫師規范化培訓任務。每年有100個國家級和北京市級繼續醫學教育項目。

北醫三院有3個教育部創新團隊：骨科、運動醫學研究所、婦產科；3個教育部重點實驗室：輔助生殖、分子心血管學（參與）和視覺損傷與修復（參與）；1個國家衛生健康委重點實驗室：心血管分子生物學與調節肽；8個北京市重點實驗室：磁共振成像設備與技術、脊柱疾病研究、生殖內分泌與輔助生殖技術、心血管受體研究、運動醫學關節傷病、幽門螺桿菌感染與上胃腸疾病、眼部神經損傷重建保護與康復、神經退行性疾病生物標志物研究及轉化。

截至2018年底，北醫三院35個學科156人次擔任中華醫學會等主系列學術團體二級分會副主委以上任職；16個學科36人次在中國科技論文統計源期刊收錄雜志副主編以上人職。

北醫三院為第一完成單位，喬杰院士團隊牽頭的“配子胚胎發育研究與生育力改善新方法的應用”研究榮獲2017年國家科技進步獎二等獎，“生殖細胞發育的表觀遺傳調控機制及體外干預方法研究”項目榮獲2018年中華醫學科技一等獎；骨科劉忠軍教授團隊牽頭的“3D打印鈦合金骨科植入物的臨床應用與關鍵技術研究”榮獲2018年北京市科學技術獎一等獎。

2018年，北醫三院輔助生殖技術系列研究成果作為改變民生的臨床技術唯一代表，入選“偉大的變革——慶祝改革開放40周年大型展覽”。