海軍總醫院始建于1954年，在中央領導、軍委和海軍領導的直接關懷下，經過半個多世紀的開拓與發展,已建設成為一所技術先進、設備精良、專科齊全、人才優勢、服務竭誠，集醫療、教學、科研為一體的現代化醫院。海軍總醫院首批列為三級甲等醫院，首批納入北京市大病統籌定點醫院，首批確認為國家醫療保險定點醫院。海軍總醫院曾連續三年獲得全軍優質服務白求恩杯，連續五年被評為為部隊服務先進醫院。

海軍總醫院座落在玉淵潭湖畔，彼鄰三環路主干線，占地約 16 萬平方米，有專業科室56個，展開床位1776余張，其中內科大樓1013張，外科樓763張，擁有耳鼻咽喉科、神經外科、高壓氧科、優生優育指導中心和航海航空醫學中心5個全軍醫學專科中心；擁有腰椎間盤疾病診治中心、結節病中心和視光學疾病中心3個全軍專病中心；擁有海軍神經疾病研究所和核醫學科、骨科、呼吸內科、心血管內科、眼科5個海軍醫學專科中心；醫院作為博士后科研工作站，是第二軍醫大學、南方醫科大學、安徽醫科大學三所高等學府的臨床醫學院；是全軍神經疾病護理示范基地；是國家藥物臨床試驗機構。

海軍總醫院先后斥資4.5億元，引進現代化大型高壓氧艙群、高低壓兩用艙、北京市第一臺256層CT和國內最大最完善自動化檢驗流水線等一系列高端醫療硬件設備；擁有全國優秀共產黨員、白求恩獎章獲得者馮理達，海軍首位國際南丁格爾獎獲得者、第三屆全國道德模范王文珍等一批先進典型；擁有碩士以上學歷醫務人員400余人。

海軍總醫院軟硬件設施齊備，學科人才梯次合理，科研技術實力雄厚，年開展新技術、新業務100余項，累計獲國家與軍隊科技成果獎600余項。醫院是被總部評為首批“三級甲等醫院”，連續三年榮獲“全軍優質服務白求恩杯”，連續七次被總后評為“全軍為部隊服務先進醫院”。

醫院著眼提高海上醫療衛勤保障能力，不斷加大醫療科研力度，逼近實戰錘煉海上醫療隊，鑄造出強有力的海上醫療衛勤保障力量，先后執行抗擊非典、抗震救災、慶祝海軍建軍60周年多國海軍活動、全員滿裝滿負荷檢驗性訓練、新型海上醫療裝備保障能力檢驗演示等多次任務，圓滿完成“和諧使命-2010”、出訪亞非五國及為亞丁灣護航官兵服務、“和諧使命-2011”任務，受到各級首長、廣大官兵、到訪國官員和民眾的高度贊譽。

海軍總醫院全體醫護人員堅持以“姓軍為兵”為宗旨，本著“從嚴治院、質量建院、特色立院、科技興院”的理念踏上跨越發展的征程，努力打造官兵滿意、百姓稱心的現代化綜合性醫院。