1948年與北方大學(xué)醫(yī)學(xué)院合編為華北醫(yī)科大學(xué)，1951年命名為中國(guó)人民解放軍第一軍醫(yī)大學(xué)，1959年更名為吉林醫(yī)科大學(xué)，1978年更名為白求恩醫(yī)科大學(xué)，2000年與原吉林大學(xué)、吉林工業(yè)大學(xué)，長(zhǎng)春科技大學(xué)、長(zhǎng)春郵電學(xué)院合并成為新的吉林大學(xué)。

合校以來(lái)，學(xué)校不斷探索和完善綜合性大學(xué)舉辦醫(yī)學(xué)教育的管理體制和運(yùn)行機(jī)制。2003年成立了白求恩醫(yī)學(xué)部，2007年成立了白求恩醫(yī)學(xué)院，增加了其對(duì)三個(gè)附屬醫(yī)院教學(xué)、學(xué)生管理等工作的統(tǒng)籌和協(xié)調(diào)職能。2012年，學(xué)校根據(jù)教育部《關(guān)于進(jìn)一步推進(jìn)教育部直屬高校醫(yī)學(xué)教育管理體制改革的意見(jiàn)》（教直〔2012〕1號(hào)）的文件精神，進(jìn)一步推進(jìn)醫(yī)學(xué)教育管理體制改革，賦予了白求恩醫(yī)學(xué)部實(shí)質(zhì)性的管理職能，由具有醫(yī)學(xué)背景的副校長(zhǎng)兼任白求恩醫(yī)學(xué)部學(xué)部長(zhǎng)，分管醫(yī)學(xué)教育工作。

學(xué)校黨委在醫(yī)學(xué)部設(shè)立了黨工委和紀(jì)工委，黨工委書記由學(xué)校黨委副書記兼任。學(xué)校對(duì)醫(yī)學(xué)教育履行統(tǒng)籌規(guī)劃、宏觀管理、資源投入和領(lǐng)導(dǎo)干部管理職責(zé)，學(xué)部機(jī)關(guān)設(shè)立綜合辦公室、醫(yī)院管理辦公室、人才培養(yǎng)辦公室、學(xué)術(shù)工作辦公室和學(xué)生工作辦公室五個(gè)管理部門，在學(xué)校統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)下對(duì)醫(yī)學(xué)教育工作進(jìn)行統(tǒng)籌、協(xié)調(diào)和管理。

學(xué)部下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、藥學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、臨床醫(yī)學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院6個(gè)學(xué)院和第一醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第一學(xué)院）、第二醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第二學(xué)院）、中日聯(lián)誼醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第三學(xué)院）、口腔醫(yī)院（口腔醫(yī)學(xué)院）4所附屬醫(yī)院，以及1個(gè)再生醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所（依托藥學(xué)院）。

全日制普通本科專業(yè)有臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)（五年制、5+3一體化）、口腔醫(yī)學(xué)專業(yè)（五年制、5+3一體化）、預(yù)防醫(yī)學(xué)專業(yè)、放射醫(yī)學(xué)專業(yè)、信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)（醫(yī)藥）、藥學(xué)專業(yè)、臨床藥學(xué)專業(yè)、生物工程專業(yè)、護(hù)理專業(yè)、康復(fù)治療學(xué)專業(yè)。共有在讀學(xué)生9881人，其中本科生（含四年制、五年制、5+3一體化）5185人、研究生4696人。擁有一級(jí)學(xué)科博士授權(quán)點(diǎn)7個(gè)，二級(jí)學(xué)科博士授權(quán)點(diǎn)58個(gè)，碩士授權(quán)點(diǎn)59個(gè)，博士后流動(dòng)站6個(gè)。

現(xiàn)有在編職工7801人，其中教師1989人，教授583人，副教授799人；專業(yè)技術(shù)人員6299人(含附屬醫(yī)院醫(yī)療教師1534人)；聘用制人員11034人。博士生導(dǎo)師309人，碩士生導(dǎo)師1393人。中國(guó)工程院雙聘院士13人，國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)學(xué)科評(píng)議組成員2人，海外高層次人才引進(jìn)計(jì)劃入選專家6人，“萬(wàn)人計(jì)劃”入選者3人，國(guó)家教學(xué)名師1人，國(guó)家“973”計(jì)劃（含重大科學(xué)研究計(jì)劃）項(xiàng)目首席科學(xué)家2人，教育部“長(zhǎng)江學(xué)者獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃”入選者2人，“長(zhǎng)江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃”創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)3個(gè),國(guó)家優(yōu)秀青年基金獲得者2人，吉林省“長(zhǎng)白山學(xué)者”入選13人，全國(guó)模范教師1人，國(guó)家優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)1個(gè)，省級(jí)教學(xué)名師8人，吉林大學(xué)唐敖慶特聘教授6人。

學(xué)部緊緊圍繞國(guó)家“雙一流”的戰(zhàn)略決策，積極推動(dòng)“人與動(dòng)物共有醫(yī)學(xué)”交叉學(xué)科群的建設(shè)。現(xiàn)有二級(jí)學(xué)科國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科1個(gè)，吉林省重中之重學(xué)科1個(gè)，吉林省優(yōu)勢(shì)特色重點(diǎn)學(xué)科6個(gè)。據(jù)基本科學(xué)指標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)（ESI）公布的數(shù)據(jù)，截至2019年3月，臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)與生物化學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)、藥理學(xué)和毒理學(xué)、免疫學(xué)5個(gè)醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科進(jìn)入世界學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)前1%。

現(xiàn)有國(guó)家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室1個(gè)、教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2個(gè)、衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)、科技部國(guó)際科技合作基地1個(gè)、國(guó)家中醫(yī)藥管理局三級(jí)實(shí)驗(yàn)室7個(gè)，省級(jí)科研機(jī)構(gòu)143個(gè)，科研流動(dòng)站16個(gè)。

現(xiàn)有國(guó)家級(jí)精品課4門，省級(jí)精品課16門，國(guó)家級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng)4項(xiàng)，省部級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng)86項(xiàng)。國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心1個(gè)，國(guó)家級(jí)臨床教學(xué)培訓(xùn)示范中心1個(gè)。

現(xiàn)有集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、保健和康復(fù)于一體的附屬醫(yī)院4所，其中綜合醫(yī)院3所、口腔專科醫(yī)院1所，均為三級(jí)甲等醫(yī)院，綜合醫(yī)院還設(shè)有分部5個(gè)。附屬醫(yī)院總占地面積618342平方米，總建筑面積1053316平方米；床位數(shù)11800張；固定資產(chǎn)總價(jià)值66.31億元。設(shè)有200個(gè)臨床科室、48個(gè)醫(yī)技科室。2018年附屬醫(yī)院門診總量7606173人次，總出院病人數(shù)516943人次；手術(shù)量182966例。共有國(guó)家級(jí)臨床重點(diǎn)專科建設(shè)項(xiàng)目27個(gè)，吉林省醫(yī)療質(zhì)量控制中心17個(gè)。

學(xué)部始終重視對(duì)外交流與合作，已先后同日本、加拿大、美國(guó)、英國(guó)、瑞典、香港等近30個(gè)國(guó)家和地區(qū)的院校和學(xué)術(shù)團(tuán)體建立了長(zhǎng)期的學(xué)術(shù)交流關(guān)系。在腫瘤學(xué)、婦幼衛(wèi)生與計(jì)劃生育、放射醫(yī)學(xué)、地方病學(xué)等方面，醫(yī)學(xué)部與世界衛(wèi)生組織、兒童基金會(huì)、國(guó)際原子能機(jī)構(gòu)等國(guó)際組織有著良好的合作關(guān)系。近年來(lái)，留學(xué)生教育工作也得到快速發(fā)展，學(xué)部以國(guó)際醫(yī)學(xué)教育標(biāo)準(zhǔn)和生源國(guó)衛(wèi)生執(zhí)業(yè)要求為導(dǎo)向，積極采取多項(xiàng)措施，不斷提升醫(yī)學(xué)留學(xué)生教學(xué)質(zhì)量。現(xiàn)有來(lái)自60個(gè)國(guó)家的本、碩、博及高級(jí)進(jìn)修生等各層次留學(xué)生636名，是吉林大學(xué)辦學(xué)規(guī)模最大的留學(xué)生教育學(xué)部，初步建成了全方位、多層次的醫(yī)學(xué)留學(xué)生培養(yǎng)格局。

白求恩醫(yī)學(xué)部將依托綜合性大學(xué)優(yōu)勢(shì)，著力加強(qiáng)人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、學(xué)科建設(shè)和師資隊(duì)伍建設(shè)，提高醫(yī)療服務(wù)質(zhì)量和水平，繼承和發(fā)揚(yáng)白求恩優(yōu)良傳統(tǒng)，創(chuàng)造吉林大學(xué)醫(yī)學(xué)事業(yè)新的輝煌。