2000年，原吉林大學、吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院合并組建新吉林大學。2004年，原中國人民解放軍軍需大學轉隸并入。

學校學科門類齊全，下設46個學院，涵蓋哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、農學、醫學、管理學、藝術學等12大學科門類；有本科專業139個，一級學科碩士學位授權點60個，一級學科博士學位授權點48個，二級碩士學位授權點298個，二級博士學位授權點264個，博士后科研流動站42個；有一級學科國家重點學科4個（覆蓋17個二級學科），二級學科國家重點學科15個，國家重點（培育）學科4個。13個學科（領域）的ESI排名進入全球前1%，其中2個學科排名進入全球前1‰。

學校師資力量雄厚，有教師6624人，其中教授2218人，博士生指導教師1618人。中國科學院和中國工程院院士10人，雙聘院士51人，哲學社會科學資深教授7人，國務院學位委員會學科評議組成員20人，“萬人計劃”入選者39人，國家級教學名師7人，中央馬克思主義理論研究和建設工程項目首席專家5人，國家“973”計劃（含重大科學研究計劃）項目首席科學家6人，國家有突出貢獻的中青年專家15人，國家“百千萬人才工程”入選專家31人，教育部“長江學者獎勵計劃”入選者59人，國家杰出青年基金獲得者33人，國家優秀青年基金獲得者31人，吉林省“長白山學者”人選90人。

學校現有國家重點實驗室5個，國家工程實驗室1個，國家地方聯合工程實驗室6個，國家工程技術研究中心1個，教育部人文社會科學重點研究基地6個，教育部重點實驗室12個（其中包含2個籌建的教育部重點實驗室），教育部工程研究中心5個，其他行業部委重點實驗室21個。學校承擔了大量國家級和省部級科研項目，產出了一批產業化前景好、技術含量高的高新技術成果。

學校已建立起學士－碩士－博士完整的高水平人才培養體系。在校全日制學生72376人，其中博士生7813人，碩士生19059人，本科生41734人，專科生1355人，留學生2415人。

學校聚焦名校合作，逐步完善全球網絡布局，目前，已經與40個國家和地區的292所高校和科研機構建立了合作關系。其中，排名世界前100的45所，前200的64所。學校與12個國家的高校和科研機構合作共建了38個中外合作平臺。

學校堅持“統籌謀劃、規范管理、科學運營”的指導方針，積極深化校辦產業改革。堅持“校企分開，放管結合”，打造以資本為紐帶、以市場為導向、以“學校-吉大控股-投資企業”為核心的管理體制機制。依托學校科技、人才優勢，借助政府、企業等資金支持，創辦科技創新型企業，以科技園發展中心和吉大孵化器為平臺，推進學校科技成果產業化。吉大出版社、吉大致遠、吉大通信等企業發展勢頭良好。學校科技園為國家大學科技園。

學校現有6個校區7個校園，校園占地面積611萬多平方米，校舍建筑面積276萬平方米。學校在珠海市建有珠海校區，占地面積5000畝。學校圖書館各類藏書757萬冊，已被確定為聯合國教科文組織、聯合國工業發展組織和世界銀行的藏書館。經教育部批準建設在我校的CALIS東北地區中心為全國七大中心之一。

學校以“學術立校、人才強校、創新興校、開放活校、文化榮校”為發展戰略，奮斗目標是：到2020年建成國內一流、國際知名的高水平研究型大學，接近或躋身世界一流大學行列。成為在國家和區域經濟社會發展中具有重要地位的高素質創新人才培養、高水平科學研究和成果轉化、高質量社會服務、高起點國際交流合作、先進文化引領的重要基地；成為讓學生全面發展、讓教職工引以自豪、讓社會高度贊譽、讓世界廣泛認同的大學。到建校100周年時，把吉林大學建成中國特色世界一流大學。

在建設世界一流大學的進程中，吉林大學將努力做到在關心國家命運、服務國家戰略上有所作為，讓黨和國家滿意；在勇擔社會責任、滿足社會對優質高等教育不斷提高的要求上有所進步，讓廣大人民群眾滿意；在堅持以人為本、實現好維護好發展好學校廣大師生員工根本利益上有所建樹，讓廣大師生員工滿意。