惠州市第二婦幼保健院始建于1974年，前身是惠州市婦幼保健所、惠州市婦幼保健院，2009年更名為惠州市第二婦幼保健院，2016年與原惠城區人口和計劃生育服務站合并成立惠州市第二婦幼保健計劃生育服務中心，2017年成為廣東省婦幼保健院緊密型醫聯體，2018年成為廣東醫科大學附屬惠州婦女兒童醫院，是隸屬惠城區政府的非營利性公立醫院，現已發展成為一所集預防、醫療、保健、科研和教學于一體的三級甲等婦幼保健院，是惠州市醫保合作醫療定點單位，惠州市艾滋病母嬰阻斷試點單位，廣東省愛嬰醫院，廣東省唯一承擔中國/聯合國人口基金第五周期，第六周期國家項目任務工作單位。 

醫院位于西湖之畔、蘇居之濱，總占地面積約 1.6 萬平方米，建筑面積約 5.5 萬平方米，現有上排總院區、上排時代分院區、江北分院、南壇分院四個院區，編制床位500 張。現有在崗人員 780多人。2019 年服務門急診患者近 84 萬人次、收治患者近2.5萬人次、助產分娩近 1.1 萬人，醫院綜合實力在全國縣區級婦幼保健院中排名前 20 之列。醫院學科優勢突出，專業特色明顯，技術力量雄厚。

目前醫院與美國太平洋醫療中心合作建立全國首家“中美產科培訓（惠州）基地”，并同時擁有5個市級醫學重點專科—婦科、產科、新生兒科、兒科、臨床護理，其中新生兒科重癥患兒搶救和早產兒救治水平達市內領先水平；設有廣東省新生兒護理搶救中心惠州市分中心、廣東省新生兒疾病篩查中心惠州分中心、廣東省婦幼保健院乳腺病防治中心惠州分中心等一批省市技術協作中心以及生殖醫學中心（惠州市除中心醫院外第二個能夠提供輔助生殖技術和試管嬰兒項目的特色中心）、產前診斷中心、兒童聽力篩查管理和診斷中心（惠州市首家）、中醫康復科、小兒神經內科、心理科、小兒外科等一批特色專科，形成了孕產保健及高危孕產婦救治、危重新生兒搶救、小兒外科、兒科危重癥救治、宮頸疾病及婦科腫瘤篩查和治療、乳腺癌防治、出生缺陷綜合防治與產前診斷、兒童保健、中醫康復等成熟、規范的健康服務體系，目前正開展多項地區領先的特色服務，是廣東省普通高等醫學院校教學醫院、暨南大學醫學研究生培養基地、廣東省婦幼保健院規培協同基地。

醫院始終秉承“拼搏、奉獻、開拓、進取”的院訓和“道行健、術精湛、志弘毅、習勤勉”的核心價值觀，堅持“以保健為中心，以保障生殖健康為目的，保健與臨床相結合，面向基層，面向群體和預防為主”的婦幼衛生工作方針，堅持“母親安全，兒童優先”的服務宗旨，充分發揮臨床與保健相結合的辦院特色，圍繞“孕產保健部、婦女保健部、兒童保健部、計劃生育技術服務部”四大部提供全方位的全生命周期保健服務，促使醫院的特色品牌及影響力不斷擴大，曾先后榮獲“全國先進模范職工之家”、“全國巾幗文明崗”、“全國三八紅旗集體”、“國家級母嬰友好醫院”、“國家級青年文明號”、“廣東省五一勞動獎狀”等榮譽，為保障廣大婦女兒童群體健康作出了積極的貢獻。