醫院經過幾代人的創建與傳承，廈門大學附屬第一醫院已形成了以15位名醫為楷模，一大批學有專長、術有專攻的學科帶頭人為領軍，眾多嶄露頭角的青年才俊為后備力量的人才隊伍。現有中高級專業技術人才2138人，博士、碩士676人，享受國務院特殊津貼專家16人，擔任中華醫學會等國家級各專業委員會委員專家30余人。

醫院已獲各級課題資助，包括國家“863”和“973”子課題、國家自然科學基金、國家“十一五”科技支撐計劃等國家級課題。獲省部級、市各級科技進步獎，包括教育部科技進步一等獎、解放軍科技進步二等獎、省科技進步二等獎、廈門市科技進步一等獎等。已獲得各級各類科研項目共75項。國科金立項數連續三年居廈門醫療系統首位，截至目前，全院共發表SCI論文700余篇。

已擁有福建省糖尿病轉化醫學重點實驗室、福建省糖尿病中醫藥重點研究室2個省級平臺；

6個廈門市重點實驗室：廈門市心臟電生理重點實驗室、廈門市風濕免疫重點實驗室、廈門市腫瘤早期診療重點實驗室、廈門市泌尿系腫瘤和結石重點實驗室、廈門市腦科中心重點實驗室、廈門市胸部腫瘤和診療重點實驗室；

 6個廈門大學院級科研平臺：廈門大學醫學院肺癌研究所、廈門大學醫學院自身免疫研究所、廈門大學醫學院兒童醫學研究所、廈門大學醫學院血液病研究所廈門大學醫學院心律失常與心臟電生理研究所、廈門大學醫學院神經外科研究所。

 醫院設有中心實驗室、風濕免疫實驗室、生物樣本庫、心臟介入研究室、高血壓研究室、顯微外科研究室、神經病學研究室、腫瘤研究室等20多個臨床研究室，廈門市重大科技創新平臺——代謝性疾病等系統生物學研究平臺。此外，與廈門大學共建“福建省神經系統疾病重點實驗室”、“廈門市代謝性疾病重點實驗室”等研究機構。2006年通過國家審批，設立福建省地市級醫院首家博士后工作站，培養博士后30余名。共有心血管、內分泌、神經內科、神經外科、腎病、風濕免疫、醫學影像（核醫學）、糖尿病等20個專業獲得國家藥物臨床試驗資格，是福建省獲批專業最多，也是廈門市最早一家獲得國家藥物臨床試驗資格的機構。2013年獲得衛計委臨床藥師規培基地，成為閩西南首家承擔三級醫院臨床藥師1年期規培的醫院。2010年，檢驗科順利通過中國合格評定國家認可委員會（CNAS）評審，成為福建省首家獲得國際標準ISO15189醫學實驗室質量與能力認可的醫學實驗室。

設立內、外、婦、兒、急診、護理等23個臨床教研室，現有臨床教師826人，其中博士149人、碩士301人，博碩研究生導師89人。現有20個國家級住院醫師規范化培養基地以及福建省17個住院醫師規范化培訓基地。2016年共接收各院校本科生、研究生、住培學員、進修生等共計1837名。2016年，醫院成立臨床教學技能培訓中心，新增教學用房821平方米，增加15個功能實訓區（含內外婦兒模擬手術ICU全科等），是籌建國家健康醫療領域廈門開放大學的核心單位。

 醫院與德國杜塞爾多夫大學醫學院、新加坡國立大學醫院、新加坡中央醫院、新西蘭惠靈頓兒童醫院、牛津大學醫學院、美國戴維斯加州大學腫瘤研究中心、美國Vanderbilt（范德堡）大學影像科學研究院神經影像研究中心建立互助合作聯系，聯合培養學科骨干人才。

 作為公立醫院，始終堅持“讓病人滿意、讓職工滿意，創建國家優質醫院”的工作目標，持續深入推進七大學科集群建設、醫學人文建設，開展全預約、全自助服務，實行首席質控師制度。開通腦中風、腦外傷綠色通道，提高顱腦損傷病人搶救成功率。采用接收、托管等形式，將三甲醫院優質的醫療資源和服務水平向社區、廈門島外新城區和農村延伸，探索醫療一體化新路。2007年被國家人事部、衛生部評為全國衛生系統先進集體；2011年，被評為信息化創新醫療服務模式十佳醫院；2010、2011連續兩年獲評全國百家改革創新醫院；2012年，在衛生部和中華總工會聯合舉辦的全國衛生系統護士崗位創新技能競賽中，我院榮獲兒科護理專業第一名；2013年，在全省三級醫院和省屬二級醫院滿意度調查中名列第一。自衛生部批準每年評選醫師行業最高獎項——中國醫師獎以來，醫院已8次獲得該獎項。